Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IfnkQ7TSL0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IfnkQ7TSL0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IfnkQ7TSL0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnkQ7TSL0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms