Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp6r1Q7TSI3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp6r1Q7TSI3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms