Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms