Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2lQ7TS74 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms