Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms