Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim17Q7TPM3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms