Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mycbp2Q7TPH6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms