Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp3Q7TNH6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms