Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms