Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubfd1Q78JW9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Ubfd1Q78JW9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ubfd1Q78JW9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubfd1Q78JW9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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