Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme8Q715T0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms