Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms