Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NinlQ6ZQ12 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NinlQ6ZQ12 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms