Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chsy1Q6ZQ11 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Chsy1Q6ZQ11 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms