Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Glis3Q6XP49 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Glis3Q6XP49 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms