Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2eQ6VUP9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2eQ6VUP9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 650.8 ms