Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rhox8Q6VSS7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rhox8Q6VSS7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rhox8Q6VSS7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rhox8Q6VSS7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rhox8Q6VSS7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Rhox8Q6VSS7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rhox8Q6VSS7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rhox8Q6VSS7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rhox8Q6VSS7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rhox8Q6VSS7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rhox8Q6VSS7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Rhox8Q6VSS7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rhox8Q6VSS7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms