Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms