Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup98Q6PFD9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms