Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms