Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms