Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3bQ6PDC0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms