Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trak1Q6PD31 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms