Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp49Q6P9L4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms