Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx6Q6P8X1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx6Q6P8X1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms