Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tsen2Q6P7W5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsen2Q6P7W5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms