Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc148Q6P5U8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms