Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3aQ6P2K6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms