Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpbp1Q6NXH3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms