Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HelbQ6NVF4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms