Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn11Q6J756 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms