Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms