Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt87Q6IMF0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt87Q6IMF0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt87Q6IMF0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms