Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt40Q6IFX3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms