Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lemd2Q6DVA0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lemd2Q6DVA0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lemd2Q6DVA0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lemd2Q6DVA0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lemd2Q6DVA0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lemd2Q6DVA0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lemd2Q6DVA0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lemd2Q6DVA0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lemd2Q6DVA0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lemd2Q6DVA0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lemd2Q6DVA0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lemd2Q6DVA0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lemd2Q6DVA0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lemd2Q6DVA0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lemd2Q6DVA0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lemd2Q6DVA0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lemd2Q6DVA0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lemd2Q6DVA0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lemd2Q6DVA0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms