Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx11Q6AXC6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx11Q6AXC6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms