Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrcc1Q69ZB0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms