Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CltcQ68FD5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms