Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms