Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja3Q64448 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms