Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic2Q62520 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic2Q62520 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms