Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vil1Q62468 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms