Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nptx1Q62443 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms