Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha6Q62413 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms