Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms