Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zpr1Q62384 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zpr1Q62384 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zpr1Q62384 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zpr1Q62384 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zpr1Q62384 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zpr1Q62384 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zpr1Q62384 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms