Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SypQ62277 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SypQ62277 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SypQ62277 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SypQ62277 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SypQ62277 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SypQ62277 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SypQ62277 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SypQ62277 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SypQ62277 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SypQ62277 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SypQ62277 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SypQ62277 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SypQ62277 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SypQ62277 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SypQ62277 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SypQ62277 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SypQ62277 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SypQ62277 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SypQ62277 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SypQ62277 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SypQ62277 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SypQ62277 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SypQ62277 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SypQ62277 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SypQ62277 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SypQ62277 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SypQ62277 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SypQ62277 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SypQ62277 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SypQ62277 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SypQ62277 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SypQ62277 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SypQ62277 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SypQ62277 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SypQ62277 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SypQ62277 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SypQ62277 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SypQ62277 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SypQ62277 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SypQ62277 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SypQ62277 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms