Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf1Q62187 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ttf1Q62187 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ttf1Q62187 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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