Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema3bQ62177 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms