Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3bQ62141 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms